محاسبه حقوق و دستمزد کارکنان در سازمان‌ها و موسسات فعالیتی‌ست که در صورت بهره نجستن از ابزارهای فناوری اطلاعات می‌تواند فعالیتی وقت‌گیر با احتمال بروز خطاهای انسانی باشد. به کارگیری یک سیستم مکانیزه برای محاسبه حقوق و دستمزد کارکنان می‌تواند با کاستن خطاهای انسانی، این فعالیت پیچیده را در کوتاه‌ترین زمان ممکن سازد.
سیستم حقوق و دستمزد «پگاه‌سیستم» نیز به همین منظور طراحی شده‌است و به واحدهای مالی یک شرکت در محاسبه‌ی حقوق و دستمزد کارکنان در کوتاه‌ترین زمان و با پرهیز از خطاهای احتمالی کمک می‌کند.

مهم‌ترین ویژگی‌ها و امکانات:
• ثبت اطلاعات کامل مشخصات پرسنلی
• تعريف انواع وام، تسويه وام، تعديل وام، ....
• تعریف انواع گروه استخدام
• تعریف انواع عوامل حقوق ( افزاینده، کاهنده، تعهدات کارفرما) با امكان  فرمول نويسي توسط کاربر
• صدور انواع احکام پرسنلی از قبيل استخدام، ترك كار، حقوقي، غير حقوقي و ........
• امکان محاسبه و پرداخت‌های موردی طی ماه و صدور سند حسابداری آن
• محاسبه معوقه حقوق و صدور سند حسابداری آن
• تعریف انواع كاركرد و اختصاص این عوامل به انواع استخدام
• تعریف جدول مالیات توسط کاربر
• امکان محاسبه مالیات برای وضعیت‌های مختلف ( عادی، 50%، جانباز و ...)
• امکان دریافت اطلاعات كاركرد بصورت فایل‌های TXT, Excel و....
• امکان محاسبات طی ماه از قبیل مساعده گروهی، پاداش، آکورد، ...... و امكان دريافت اطلاعات از طريق فايل
• امکان محاسبه مالیات به روش مالیات سالانه و ماهانه
• امکان تعریف انواع شرکت های بیمه و تعریف فرمول محاسباتی آن
• تعریف انواع عوامل دوره ای و تعریف فرمول آن مانند بازخرید خدمت، مرخصی و ...
• محاسبه ذخیره عوامل دوره ای به صورت ماهیانه و صدور اسناد حسابداري
• امکان گروه بندی حقوقی کارکنان و محاسبه عوامل حقوقی برای هر گروه به صورت جداگانه
• امکان تعریف فرمول و نحوه پرداخت حقوق به صورت کاملا پارامتریک توسط کاربر
• صدور سند حسابداری به صورت اتوماتیک
• تهیه دیسک بیمه تامین اجتماعی همراه با قابلیت تغییر فرمت دیسکت
• محاسبه تسويه حساب كاركنان

گزارش‌ها:
• تهیه گزارش به صورت کاملاً دايناميك ( تعریف فیلد و بکارگیری فرمول در محاسبه آن )
• گزارش های گوناگون از بیمه، مالیات، مرخصی، مزایای استخدامی و ...
• تهیه گزارش های جامع از مراکز هزینه
• تهیه گزارش های جامع از هزینه حقوق بر اساس واحدهای مختلف
• امکان گزارش گیری آسان و سریع برای ماه‌ها و دوره‌هاي مالي گذشته
• چاپ انواع فیش حقوقی از قبیل حقوقی، عیدی، معوقه و ...
• گزارش مرور حقوق و دستمزد
• گزارش حسابرسی
• ارائه گزارش پرداختي پرسنل به تفكيك بانك، صندوق
• طراحي گزارشات و ارائه آن به صورت فرمت DBF، TXT ، چاپي و نموداری