«پگاه‌سیستم» به عنوان شرکتی پیشرو همواره در شناسایی نیازهای جدید بازار و پیگیری آخرین تغییرات و پیشرفت‌های تکنولوژیک مرتبط با صنعت نرم‌افزار فعال بوده و واحد تحقیق و توسعه (R&D) كه مستقیما زیر نظر مدیرعامل فعالیت می‌نماید هسته اولیه فعالیتهای تحقیقاتی درشرکت مي‌باشد.  به طور عمده فعالیت‌هایی از قبیل ارتقاء کیفیت محصول، شناسایی نیازهای جدید بازار، طراحی محصول جدید، انتقال و جذب فناوری‌ها، کسب دانش مورد نیاز سازمان در چارچوب سیاست‌های اصلی شرکت از وظایف اصلی واحد تحقیق وتوسعه در«پگاه‌سیستم» می باشد.